Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TRIM28Q13263 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRIM28Q13263 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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