Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SRSF5Q13243 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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