Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NFIAQ12857 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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