Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TROQ12816 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TROQ12816 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TROQ12816 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TROQ12816 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TROQ12816 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
TROQ12816 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TROQ12816 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
TROQ12816 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TROQ12816 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TROQ12816 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TROQ12816 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TROQ12816 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TROQ12816 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TROQ12816 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TROQ12816 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TROQ12816 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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