Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRMP28827 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRMP28827 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
PTPRMP28827 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
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PTPRMP28827 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
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PTPRMP28827 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
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PTPRMP28827 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRMP28827 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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