Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHOC2Q9UQ13 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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