Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms