Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SKIDA1Q1XH10 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SKIDA1Q1XH10 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.7 ms