Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FXNQ16595 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FXNQ16595 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FXNQ16595 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FXNQ16595 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FXNQ16595 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FXNQ16595 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FXNQ16595 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FXNQ16595 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FXNQ16595 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FXNQ16595 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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FXNQ16595 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FXNQ16595 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
FXNQ16595 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FXNQ16595 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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