Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNHIT3Q15649 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms