Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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SNX17Q15036 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNX17Q15036 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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