Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ODF1Q14990 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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