Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NFIXQ14938 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NFIXQ14938 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms