Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IKBKEQ14164 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms