Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGB1Q14028 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CNGB1Q14028 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms