Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PKD2Q13563 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PKD2Q13563 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms