Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HDAC1Q13547 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HDAC1Q13547 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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