Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
BFSP2Q13515 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.6 ms