Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TUBB3Q13509 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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