Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPA4Q13156 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPA4Q13156 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms