Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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PGGT1BP53609 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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PGGT1BP53609 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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PGGT1BP53609 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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PGGT1BP53609 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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PGGT1BP53609 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PGGT1BP53609 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PGGT1BP53609 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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