Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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PTPRBP23467 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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PTPRBP23467 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
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PTPRBP23467 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRBP23467 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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