Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SDSP20132 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SDSP20132 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SDSP20132 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SDSP20132 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SDSP20132 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms