Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SH3BP1Q9Y3L3 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.2 ms