Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TRAPPC9Q96Q05 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC9Q96Q05 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms