Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Q1T7F1 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Q1T7F1 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Q1T7F1 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
Q1T7F1 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms