Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
MSMPQ1L6U9 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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