Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SGCAQ16586 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SGCAQ16586 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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