Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
E2F4Q16254 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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