Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC85BQ15834 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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