Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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