Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF1Q15637 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF1Q15637 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF1Q15637 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF1Q15637 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SF1Q15637 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF1Q15637 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SF1Q15637 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SF1Q15637 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SF1Q15637 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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