Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
NEDD9Q14511 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NEDD9Q14511 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms