Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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TUBA3CQ13748 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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TUBA3CQ13748 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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TUBA3CQ13748 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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TUBA3CQ13748 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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TUBA3CQ13748 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBA3CQ13748 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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