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| TOP3A | Q13472 | AC011471.1-201 | ENST00000585766 | 187 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC006504.5-204 | ENST00000592404 | 765 nt | TSL 3 BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | DEFB117-201 | ENST00000602356 | 141 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC006380.1-201 | ENST00000603598 | 186 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AL121772.2-201 | ENST00000614331 | 297 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC005562.2-201 | ENST00000618264 | 111 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | ZEB2_AS1_1.1-201 | ENST00000621504 | 128 nt | BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
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| TOP3A | Q13472 | MIER3-203 | ENST00000381213 | 5198 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.11 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC093831.2-201 | ENST00000624393 | 3427 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | PLS1-201 | ENST00000337777 | 3755 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | RNA5SP124-201 | ENST00000362739 | 110 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
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| TOP3A | Q13472 | U3.9-201 | ENST00000363823 | 204 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | Y_RNA.262-201 | ENST00000364641 | 102 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | RNU6-1264P-201 | ENST00000383891 | 107 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | MIR186-201 | ENST00000384988 | 86 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC009963.1-201 | ENST00000417265 | 157 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
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| TOP3A | Q13472 | SNORA31.21-201 | ENST00000517180 | 77 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
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| TOP3A | Q13472 | DEFB131B-201 | ENST00000530210 | 213 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AP001318.2-201 | ENST00000533378 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC100778.1-201 | ENST00000583579 | 332 nt | TSL 3 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | SNORD11B-201 | ENST00000607707 | 90 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | TCL6_2.1-201 | ENST00000615162 | 119 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | ZNF479-202 | ENST00000331162 | 2072 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | OR6C1-202 | ENST00000642104 | 2055 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | BCLAF1P1-201 | ENST00000505813 | 2752 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | RAPGEF6-202 | ENST00000308008 | 4176 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | FAM35CP-201 | ENST00000554755 | 2470 nt | BASIC | 3.1 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | SCOC-201 | ENST00000338517 | 1864 nt | TSL 4 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AL356274.2-201 | ENST00000624379 | 3752 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | RNU6-211P-201 | ENST00000384047 | 107 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | RNU6-1248P-201 | ENST00000391096 | 64 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | PVALB-202 | ENST00000404171 | 422 nt | TSL 2 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AL731684.2-201 | ENST00000426839 | 333 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC097662.1-205 | ENST00000433324 | 241 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC004386.2-201 | ENST00000441858 | 148 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | UQCRHP3-201 | ENST00000451503 | 251 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | RPS3P1-201 | ENST00000456781 | 192 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | SNORD105B-201 | ENST00000458770 | 79 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | RN7SL75P-201 | ENST00000461926 | 281 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | CFAP44-AS1-201 | ENST00000473329 | 396 nt | TSL 2 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC097501.2-201 | ENST00000502668 | 305 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC113383.1-204 | ENST00000507060 | 552 nt | TSL 3 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | RNU1-45P-201 | ENST00000517191 | 141 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC141273.1-201 | ENST00000565300 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | MIR5006-201 | ENST00000583027 | 110 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC004832.5-201 | ENST00000608677 | 401 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AL365265.1-201 | ENST00000621045 | 234 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | snoU18.1-201 | ENST00000629629 | 71 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC021753.1-201 | ENST00000635724 | 168 nt | BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | DMD-201 | ENST00000288447 | 3856 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | PPP2R5A-205 | ENST00000537030 | 1719 nt | TSL 2 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| TOP3A | Q13472 | PTER-201 | ENST00000298942 | 3448 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | USP45-208 | ENST00000500704 | 5826 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | OR51A7-202 | ENST00000641490 | 2186 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | NR3C1-212 | ENST00000504572 | 3389 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | RNU6-324P-201 | ENST00000363957 | 106 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | Y_RNA.240-201 | ENST00000364469 | 95 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | LINC00862-202 | ENST00000367356 | 759 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | RNU1-57P-201 | ENST00000384491 | 166 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | RNU6ATAC-201 | ENST00000408749 | 126 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | OOSP1P1-201 | ENST00000423265 | 274 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | AL118523.1-201 | ENST00000444436 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | AL031183.1-201 | ENST00000457667 | 207 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | RPL31P41-201 | ENST00000477967 | 372 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC025518.1-201 | ENST00000479856 | 347 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC006483.1-201 | ENST00000487308 | 313 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | TRAPPC2P7-201 | ENST00000509650 | 231 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | RNU6-344P-201 | ENST00000516635 | 111 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | AP003465.1-201 | ENST00000520575 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC106785.1-201 | ENST00000565935 | 262 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | MIR4308-201 | ENST00000580634 | 81 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | SNORD87-201 | ENST00000364849 | 89 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | Y_RNA.304-201 | ENST00000365011 | 112 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | Y_RNA.329-201 | ENST00000365209 | 107 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | SNORA18.2-201 | ENST00000383865 | 132 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | SNORA5A-201 | ENST00000384111 | 134 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | SNORA46-201 | ENST00000384762 | 135 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | TRAJ31-201 | ENST00000390506 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | RN7SKP202-201 | ENST00000410439 | 330 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC004866.1-201 | ENST00000411748 | 78 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | BTF3P11-201 | ENST00000426582 | 477 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | GOT2P5-201 | ENST00000433995 | 546 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | AC091021.1-201 | ENST00000468051 | 388 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | RPL36AP48-201 | ENST00000485521 | 314 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | TMEM132D-AS1-202 | ENST00000510001 | 293 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | SNORA31.1-201 | ENST00000515993 | 133 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | SNORA31.5-201 | ENST00000516190 | 133 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | RNU1-95P-201 | ENST00000516357 | 160 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| TOP3A | Q13472 | RNU1-128P-201 | ENST00000516704 | 160 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |