Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
MKRN4PQ13434 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
MKRN4PQ13434 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms