Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GRIN2BQ13224 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIN2BQ13224 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms