Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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BNIP3Q12983 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BNIP3Q12983 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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