Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXC5Q00444 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXC5Q00444 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms