Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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