Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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