Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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VSX1Q9NZR4 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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VSX1Q9NZR4 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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VSX1Q9NZR4 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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VSX1Q9NZR4 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VSX1Q9NZR4 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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VSX1Q9NZR4 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VSX1Q9NZR4 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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