Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LRRC27Q9C0I9 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LRRC27Q9C0I9 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.5 ms