Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXQ1Q9C009 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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