Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
Q6Q795 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Q6Q795 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
Q6Q795 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Q6Q795 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Q6Q795 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Q6Q795 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Q6Q795 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Q6Q795 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Q6Q795 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms