Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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RTL8BQ17RB0 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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RTL8BQ17RB0 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
RTL8BQ17RB0 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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