Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CDO1Q16878 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CDO1Q16878 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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