Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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PTPRNQ16849 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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PTPRNQ16849 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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PTPRNQ16849 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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PTPRNQ16849 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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PTPRNQ16849 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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PTPRNQ16849 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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PTPRNQ16849 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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PTPRNQ16849 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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PTPRNQ16849 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRNQ16849 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRNQ16849 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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