Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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RTN1Q16799 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RTN1Q16799 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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