Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
SEC23BQ15437 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SEC23BQ15437 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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SEC23BQ15437 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SEC23BQ15437 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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